日本對企業(yè)法人實(shí)行屬地稅制，在日本從事經(jīng)濟活動(dòng)的法人企業(yè)都要就其經(jīng)濟活動(dòng)中所産生的利潤在日本納稅。征稅主體爲國家及地方政府（都道府縣及市町村），征稅對象爲日本法人企業(yè)的全球收入，征稅主體對各個(gè)征稅對象擁有征稅權。當征稅對象包括境外所獲利潤時(shí)，爲避免雙重征稅，制定了境外稅額抵扣的規定，在一定范圍內，可從日本的應繳稅款中扣除境外已繳納的稅款。在日本開(kāi)展業(yè)務(wù)的跨國公司，當其獲得一定的應稅收入時(shí)，通過(guò)辦理源頭課征（即代扣代繳）或申報繳納的手續,計算和繳納應征稅額。爲避免雙重征稅和逃稅的發(fā)生，中國政府與日本政府于1984年簽署了《中日租稅條約》，1991年中國外資法改訂后，雙方政府又進(jìn)行換文重新確認了某些變更條款。

日本針對企業(yè)和個(gè)人所得征收五種稅，包括兩種國稅——法人稅、個(gè)人所得稅；三種地方稅——都道府縣民稅、事業(yè)稅、市町村民稅。針對流通交易征收四種稅，包括兩種國稅——登記許可稅、印花稅；兩種地方稅——房地産購置稅、汽車(chē)購置稅。此外，日本還針對消費和財産的所有、轉移等征收消費稅、遺産稅、贈與稅等其他約19種稅目。

日本公司的法人稅包含國稅和地方稅兩大主體，此外還必須繳納根據公司規模爲計稅標準的均攤稅等。這樣，包含地方稅后的實(shí)際稅率大約爲42%左右。具體包括：

法人稅

法人收入的22-30%。

法人居民稅

（都道府縣民稅和市町村民稅）法人稅的17.3-20.7%及根據法人規模等計算的一定金額等。

法人事業(yè)稅與地方法人特別稅

法人收入的一定比例（各都道府縣的稅率有所不同，并非一定在該范圍之內，注冊資本超過(guò)1億日元的法人須另行繳納外部標準納稅）。

所得稅

當獲得利息、分紅收入及其他收入時(shí)，原則上對在日本國內銀行存款利息代扣代繳國稅15%，地方稅5%。

消費稅

原則由最終消費者負擔。2012年3月30日，日本政府內閣會(huì )議正式通過(guò)了消費稅增稅相關(guān)法案。2013年10月1日，日本首相安倍晉三正式宣布將于2014年4月1日把消費稅由目前的5%提高到8%。同時(shí)，日本政府準備不遲于2015年10月進(jìn)一步加稅2%，將消費稅再調高到10%。

事業(yè)所費

在東京都特別區、政令指定市及其他一些指定城市擁有營(yíng)業(yè)所，且從業(yè)人員達到一定數量以上，營(yíng)業(yè)所的建筑面積達到一定面積以上時(shí)繳納。

固定資産稅

擁有土地、建筑物或其他固定資産時(shí)繳納。

汽車(chē)稅

擁有汽車(chē)者繳納。

印花稅

填寫(xiě)、出具納稅文件及合同、發(fā)票時(shí)繳納。

房地産購置稅

獲取土地、建筑物時(shí)繳納。